Diese Art der Therapie wird von einem Arzt sehr häufig angewendet. Es handelt sich hierbei um eine Zerstörung der molekularen Bindegewebsstruktur. Dies kann zum Beispiel durch eine Laser- oder Kältebehandlung erfolgen. Wobei die Kältebehandlung sogar aus der Werbung auch sehr bekannt ist und ebenso mit einem geringeren Gehalt an flüssigem Stickstoff auch für zu Hause anzuwenden ist. (Wartner®) Diese Behandlung fordert keine lokale Betäubung ist aber jedoch unangenehm und schmerzhaft. Etwa nach einer Stunde der Anwendung entsteht eine Blase, die abgetragen wird oder von alleine verschwindet.

Bei der Lasertherapie wird eine lokale Betäubung vorgenommen. Der Vorteil hierbei ist, dass Schmerzen so gut wie gar nicht vorkommen, weder während noch nach der Behandlung. Da bei der ersten Behandlung meistens nicht die komplette Warze verschwindet, muss diese dann wiederholt werden.

Die Verätzung der Warze wird meistens mit Silbernitrat oder Chloressigsäure durchgeführt. Hier ist besonders darauf zu achten, dass das umliegende Gewebe nicht in Mitleidenschaft gezogen wird. Ein regelmäßiges Eincremen dieser Haut ist zu empfehlen.