Dauert die Behandlung beziehungsweise das alleinige Verschwinden der Warze, allzu lange, kann es durchaus vorkommen, dass der Betroffene an der optischen Veränderung der Haut aus psychologischer Sicht sehr leidet. Dies hat viel mit der Lage der Warze zu tun. Tritt die Warze zum Beispiel im Gesicht auf, ist es für den Betroffenen schlimmer, als wenn sie an einer Körperstelle auftritt, die man verdecken kann.

Ansonsten können bei Behandlungsmaßnahmen, die relativ aggressiv sind, Narben entstehen, die ebenso das Wohlbefinden aus psychologischer Sicht stark beeinträchtigen können.

Ebenso sind allergische Reaktionen bei verschiedenen Behandlungsmethoden nicht auszuschließen.