Falls sich Warzen hartnäckig halten, der Behandlungserfolg lange ausbleibt oder wenn die Erkrankung das optische Erscheinungsbild stark beeinträchtigt, leiden einige Patienten auch psychisch unter ihren Warzen.

Eine Warze im Gesicht wird von den Betroffenen meist als schwerwiegender empfunden als eine, die sich in einer weniger offensichtlichen Körperregion befindet. Weiterhin können durch aggressive Behandlungsmaßnahmen Narben entstehen, die ebenfalls das seelische Wohlbefinden beeinträchtigen können.

Darüber hinaus sind allergische Reaktionen bei diversen Behandlungsmethoden nicht auszuschließen.