Die Prognose bei einer Erkrankung mit Warzen ist in der Regel gut. Die meisten (ausgenommen die Feigwarzen) heilen von alleine wieder aus. Dafür muss jedoch Zeit und Geduld mit sich gebracht werden. Leider ist es so, dass Warzen, nach einer Behandlung oder plötzlichem Verschwinden, gerne wieder zurückkommen- entweder an der selben Stelle oder an einer benachbarten Hautstelle. Ist dies der Fall, beginnt der Prozess von vorne.

In manchen Fällen fällt die Prognose schlechter aus- bei den Feigwarzen. Besteht ein ausgedehnter Befall, auch Buschke- Löwenstein- Tumore genannt, oder der Übergang zu bösartigen Tumoren, sollte umgehend die Therapie und Behandlung mit dem Arzt besprochen werden.